マルチグラフィックスは3-Way NVIDIA SLI/AMD CrossFireXに対応

「GA-990FXA-UD5 R5」の拡張スロットは、PCI-Express2.0（x16）×2、PCI-Express2.0（x8/x16形状）×1、PCI-Express2.0（x4/x16形状）×2、PCI-Express2.0（x1）×1、PCI×1の計7本。さらにAMD 990FXの持つ最大42レーン（グラフィックス用32レーン）のPCI-Express2.0を最大限に活用することで、フルレーン（x16/x16）の2-Wayまたは、x16/x8/x8の3-Wayマルチグラフィックスに対応する。

PCI-Express2.0（x16形状）スロットはx16/x16またはx16/x8/x8のレーン分割が可能。マルチグラフィックスはNVIDIA SLI/AMD CrossFire Xいずれにも対応する

Marvell「88SE9172」を2基増設し、最大10台のストレージに対応

ストレージインターフェイスは、チップセット標準のSATA3.0（6Gbps）×6に加え、Marvell「88SE9172」チップによる内蔵SATA3.0（6Gbps）×2、eSATA3.0（6Gbps）×2の計10ポートを搭載。なお、Marvell「88SE9172」チップもRAID 0/1に対応するため、パフォーマンス重視、信頼性重視いずれの構成にも対応する。

ブラックとグレーに色分けされたSATA3.0（6Gbps）ポート。前者はチップセット標準、後者はMarvell「88SE9172」で増設されている

デジアナ分離構造の高品位オーディオ回路を搭載

「GA-990FXA-UD5 R5」では、デジタルノイズの混入を防ぐため、オーディオ回路を分離させた「Dedicated Audio Hardware Zone」を採用。さらにオーディオチップにはSN比115dBのRealtek「ALC1150」を実装する他、高品質な日本ケミコン製音響用コンデンサや、TI製ヘッドホンアンプ「OPA1652」などで構成され、オンボードながら高品位なサウンドを楽しむことができる。

これまでのSocket AM3+マザーボードから、オーディオ回路は大幅にアップグレードされている
	オーディオチップにはハイエンドモデルでの採用例が多い、Realtek「ALC1150」を搭載